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发布时间:2022-04-18 03:48:00 作者:立博泰业
TwistDx仪器
RPA 非常快速,在 37~42 °C 这一通常适宜的反应温度下,只需少量核酸分子即可在 3~10 分钟(通常)内扩增至可检出水平,但这将取决于靶标大小。在大部分情况下,只需要一个人即可在半小时内采集样本、制备样本、运行检测并取得结果,并且无需培训。
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宏基因组分析首先发现Bacteroides和Prevotella是所有受试者和健康对照中变化大的菌。进一步的研究还确定了与CRC关联的新物种,其中Colinsella aerofaciens,Dorealongicatena,Porphyro-monasuenonis和Streptococcus anginosus等在III/IV中显著升高。代谢组分析发现,大肠中主要能源物质丙酸盐和丁酸盐是含量高的两种代谢物,二氢尿和尿素也存在较大差异。与健康对照组相比,MP中DCA(脱氧胆酸盐)浓度显著升高;SO中甘氨胆酸盐和牛磺胆酸盐浓度显著升高;支链氨基酸,苯丙氨酸,酪氨酸,甘氨酸,丝氨酸浓度也升高。
基于KEGG数据库筛选出1243个同源基因(KO基因)在至少一个阶段显著升高,96个KO基因在至少一个阶段显著降低。在差异显著的通路中,芳香族氨基酸代谢和产硫化物的通路与CRC相关。参与苯丙氨酸和酪氨酸合成的基因显著升高,其中pheC被确定为区分S0患者和健康对照的得分高标志物。通过构建随机森林和LASSO逻辑回归模型来区分健康对照与SO和SIII/IV。在S0分类中,特征值是包括编码环己二烯基脱水酶的pheC的KO基因;在SIII/IV分类中,特征值为已被确认为CRC标志物的P.micraP.stomatis和 F.nucleatum等口腔。
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