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发布时间:2021-12-15 03:33:00 作者:立博泰业
RPA是什么?
自PCR技术诞生以来已经有三十年了。从经典PCR、实时定量PCR再到现在的数字PCR,这一技术在不断蜕变却从未淡出我们的视野。
英国TwistDx Inc公司开发的重组酶聚合酶扩增(Recombinase Polymerase Amplification,RPA),被称为是可以替代PCR的核酸检测技术。以此为基础的TwistAmp? 核酸扩增产品,能够在15分钟内进行常温下的单分子核酸检测。该技术对硬件设备的要求很低,特别适合用于体外诊断、兽医、食品安全、生物防御和农业等领域。
PCR操作方法
这个方法很主流,也很经典。但是这个操作步骤太多,而且每次都是微量,手一抖就完蛋了。另外引物(就是拉链扣)的质量也是关键,如果错了拉链,那么整个检测前功尽弃。
当然还有机器清洗的问题,如果上一个阳性样本检测之后,没有洗干净设备,下一个本来阴性患者可能就会假阳性被误诊。中国大医院自己都有PCR检测仪器和人员,流程比较熟练。美国欧洲很多医院偏专科,综合性超大型少一些,本来很多检验都是委托外包第三方实验室。遇到疫情,着急出结果自己上手,可能有手法不纯熟的情况。如果又正好使用了某些中国的无证试剂盒厂商出品的无证试剂,多重误差叠加,准确度就会崩盘。
TwistDx试剂盒
常见的是核酸检测试剂盒。一般多为qpcr方法的,也有多重pcr的。检测新型冠状病毒特异序列的方法常见的是荧光定量PCR(聚合酶链式反应)。因PCR反应模板仅为DNA,因此在进行PCR反应前,应将新型冠状病毒核酸(RNA)逆转录为DNA。在PCR反应体系中,包含一对特异性引物以及一个Taqman探针,该探针为一段特异性寡核苷酸序列,两端分别标记了报告荧光基团和淬灭荧光基团。探针完整时,报告基团发射的荧光信号被淬灭基团吸收;如反应体系存在靶序列,PCR反应时探针与模板结合,DNA聚合酶沿模板利用酶的外切酶活性将探针酶切降解,报告基团与淬灭基团分离,发出荧光。每扩增一条DNA链,就有一个荧光分子产生。荧光定量PCR仪能够监测出荧光到达预先设定阈值的循环数(Ct值)与病毒核酸浓度有关,病毒核酸浓度越高, Ct值越小。不同生产企业的产品会依据自身产品的性能确定本产品的阳性判断值。
RPA 作为颠覆 PCR 的革命性方法的突出地位源于其特定的反应成分(表 1)和机制。 对于成功的 RPA 分析,细微差别取决于内在因素、引物、探针和核酸模板的设计; 并且与外在因素有关,如反应温度和搅拌、对错配的耐受性、和模板DNA。 此外,RPA 过程中的核酸标记、RPA 扩增子纯化和扩增后处理也是 RPA 检测成功的重要细节。 本节提供从 RPA 文献中总结的这些实用信息,作为 RPA 检测设计的指南。
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