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发布时间:2022-02-26 05:37:00 作者:立博泰业
RPA技术的基本原理
RPA技术主要依赖于三种酶:能结合单链核酸(寡核苷酸引物)的重组酶、单链DNA结合蛋白(SSB)和链置换DNA聚合酶。这三种酶的混合物在常温下也有活性,反应温度在37°C左右。
重组酶与引物结合形成的蛋白-DNA复合物,能在双链DNA中寻找同源序列。一旦引物定位了同源序列,就会发生链交换反应形成并启动DNA合成,对模板上的目标区域进行指数式扩增。被替换的DNA链与SSB结合,防止进一步替换。在这个体系中,由两个相对的引物起始一个合成事件。整个过程进行得非常快,一般可在十分钟之内获得可检出水平的扩增产物。RPA扩增的基础体系(TwistAmp? Basic)含有DNA扩增所需的所有试剂,我们只要准备好引物和模板就行。扩增结果可以通过凝胶电泳进行终点检测,产物纯化后可用于下游研究。
在这个基础体系中添入不同的酶和探针,就可以实现多样化的RPA应用。举例来说,TwistAmp? exo结合了的exo探针技术和核酸外切酶III,能实现数据的实时读取,就像荧光定量PCR一样。不过反应终点的扩增子总量有所减少,适合获得强荧光信号进行动力学分析,不适合终点检测(比如跑胶)。将exo探针技术、核酸外切酶III和逆转录酶结合起来,可以一步实现RNA模板的实时扩增。
RPA是什么?
自PCR技术诞生以来已经有三十年了。从经典PCR、实时定量PCR再到现在的数字PCR,这一技术在不断蜕变却从未淡出我们的视野。
英国TwistDx Inc公司开发的重组酶聚合酶扩增(Recombinase Polymerase Amplification,RPA),被称为是可以替代PCR的核酸检测技术。以此为基础的TwistAmp? 核酸扩增产品,能够在15分钟内进行常温下的单分子核酸检测。该技术对硬件设备的要求很低,特别适合用于体外诊断、兽医、食品安全、生物防御和农业等领域。
RPA技术
01 特别快,传统PCR要45分钟,因为要反复升温降温。RPA由于是恒温,所以只需要3-10分钟。
02 灵敏度高,因为是高度定向扩增,所以样品即便有点儿杂质也OK,免除了前处理环节,尽量多的保留了样本。
03 温度控制要求低,一般是加热到40℃,但是在紧急情况下,贴在人身上用人体的体温36℃、37℃也没问题。甚至在室温25℃,也是可以运行,就是慢点儿,要等一个小时而已。
04 适用性强,面对RNA病毒,直接在试剂里加入逆转录酶就好,一锅端。
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TwistDx试剂盒
DNA检测的原理是聚合酶链式反应(PCR)。如果你了病毒,那么应该能检测到病毒的核酸,我们可以利用体外DNA扩增的方式扩增这些核酸并检测。PCR就是一种体外DNA扩增的技术,简单来说就是可以让特定的DNA分子一条链变两条链,两条变四条,四条变八条,每个循环翻一倍。然后通过看经过多少个循环这个DNA分子的数量超过阈值,就可以计算原本样品中DNA的量(也就是说每少一个循环超过阈值说明病毒核酸的量多一倍)。一个30循环的PCR反应大概需要两小时。算上样品处理等时间应该会在四到五个小时左右,如果要等其他人一起做则更久。
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